De rust in Tromaville wordt wreed verstoord als Apocalypse Inc. de bouw aankondigt van enkele chemische fabrieken.
De lokale bevolking maakt geen schijn van kans tegen de maffia, die alles uit de kast trekt om haar plannen tot uitvoer te brengen. 'THe Toxic Avenger' is de enige die ze nog kan stoppen. Onze crimefighter worstelt echter de laatste tijd met z'n emoties en Apocalypse Inc. weet op slinkse wijze daarvan gebruik te maken. Als Toxie besluit z'n verloren gewaande vader te gaan zoeken in Tokyo is de weg vrij voor de milieucriminelen van Apocalypse Inc. om de achterblijvers in Tromaville met wrede hand te onderdrukken. Weet Toxie z'n vader te vinden en op tijd terug te keren om het kwaad te bestrijden ?