Het dodelijke T-virus, ontwikkeld door de Umbrella Corporation, blijft de wereld teisteren. Het virus transformeert de wereldbevolking in vleesetende zombies. De enige en laatste hoop voor het menselijke ras is Alice (Milla Jovovich). Zij wordt wakker in het midden van Umbrella's meest clandestiene departement. Terwijl ze op zoek gaat naar de verantwoordelijken voor het uitbreken van het virus, ontdekt ze meer en meer over haar eigen mysterieuze verleden.
Die zoektocht die haar van Tokyo naar New York, Washington, D.C. en Moskou brengt zal leiden tot een ongelofelijke openbaring. Was wat ze ooit aanvaardde als waarheid en realiteit echt?