Emma Thompson lijkt een persoon met een vreselijke verschijning en magische krachten die haar entree maakt in het huishouden van de onlangs tot weduwnaar geworden Mr. Brown (Colin Firth). Daar gaat ze de uitdaging aan om zijn zeven onhandelbare kinderen in het gareel te krijgen. De kinderen hebben het al voor elkaar gekregen om maar liefst 17 kindermeisjes tot waanzin te drijven maar wanneer Nanny McPhee eenmaal de scepter zwaait komen ze er weldra achter dat hun vervelende gedrag al snel en op magische wijze schrikbarende gevolgen heeft.