Gesloopt van verdriet na het verliezen van haar man en Humanich zoon Ethan moet astronaut Molly Woods gedwongen opgenomen worden in een “rustfaciliteit”. Ze gelooft dat haar opname onderdeel is van een samenzwering om haar stil te houden over de aanwezigheid van aliens. Molly ontsnapt maar ze krijgt te maken met een onbekende ziekte… één die waarschijnlijk te maken heeft met haar mysterieuze ontmoeting in de ruimte waardoor zij zwanger is geworden. Verraden door vrienden en bevriend geraakt met vreemden, inclusief agent JD Richter, gaat Molly op zoek naar Ethan en Adhu, haar hybride zoon, die nu meer van zijn soort heeft gemaakt. De overheid is bang dat de hybriden zullen zorgen voor het uitsterven van de mensheid daarom ontwikkelen zij een krachtig Humanich leger om tegen ze te vechten, maar de robots hebben ook eigen plannen. Het is tijd om een kant te kiezen nu de mensen strijden tegen aliens en robots.